Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mid2Q9QUS6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mid2Q9QUS6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms