Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hdgfl3Q9JMG7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hdgfl3Q9JMG7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms