Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Rabgef1Q9JM13 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rabgef1Q9JM13 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rabgef1Q9JM13 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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