Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cul3Q9JLV5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cul3Q9JLV5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms