Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

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Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Tmod4Q9JLH8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Tmod4Q9JLH8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Tmod4Q9JLH8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Tmod4Q9JLH8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Tmod4Q9JLH8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmod4Q9JLH8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Tmod4Q9JLH8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Tmod4Q9JLH8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmod4Q9JLH8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms