Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pkd2l2Q9JLG4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pkd2l2Q9JLG4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms