Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cnot9Q9JKY0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cnot9Q9JKY0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms