Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scamp4Q9JKV5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Scamp4Q9JKV5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms