Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ldb3Q9JKS4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ldb3Q9JKS4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms