Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pole3Q9JKP7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pole3Q9JKP7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms