Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scamp5Q9JKD3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scamp5Q9JKD3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms