Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cnga3Q9JJZ8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnga3Q9JJZ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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