Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx20Q9JJY4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ddx20Q9JJY4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ddx20Q9JJY4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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