Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nrip3Q9JJR9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nrip3Q9JJR9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms