Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cml1Q9JIZ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cml1Q9JIZ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms