Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl1Q9JI74 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl1Q9JI74 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms