Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxcl11Q9JHH5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Cxcl11Q9JHH5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Cxcl11Q9JHH5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Cxcl11Q9JHH5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Cxcl11Q9JHH5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Cxcl11Q9JHH5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxcl11Q9JHH5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms