Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tm9sf3Q9ET30 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf3Q9ET30 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms