Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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Usp29Q9ES63 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp29Q9ES63 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Usp29Q9ES63 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Usp29Q9ES63 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp29Q9ES63 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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