Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ripk4Q9ERK0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ripk4Q9ERK0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms