Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Clstn2Q9ER65 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Clstn2Q9ER65 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clstn2Q9ER65 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms