Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r48Q9EQ52 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r48Q9EQ52 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r48Q9EQ52 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r48Q9EQ52 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn1r48Q9EQ52 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r48Q9EQ52 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r48Q9EQ52 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms