Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SgshQ9EQ08 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SgshQ9EQ08 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms