Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Aph1cQ9DCZ9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Aph1cQ9DCZ9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms