Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Tspan4Q9DCK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan4Q9DCK3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Tspan4Q9DCK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tspan4Q9DCK3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Tspan4Q9DCK3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tspan4Q9DCK3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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