Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC3

Ccdc107, Coiled-coil domain-containing protein 107, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc107Q9DCC3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc107Q9DCC3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc107Q9DCC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms