Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp27a1Q9DBG1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms