Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smg9Q9DB90 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smg9Q9DB90 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms