Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc89Q9DA73 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms