Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sgf29Q9DA08 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sgf29Q9DA08 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms