Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y8

Ssmem1, RIKEN cDNA 1700025E21, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssmem1Q9D9Y8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssmem1Q9D9Y8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssmem1Q9D9Y8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms