Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9S1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9S1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D9S1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms