Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q9D9H8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9D9H8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q9D9H8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q9D9H8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Q9D9H8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms