Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tvp23bQ9D8T4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tvp23bQ9D8T4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms