Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9D8Q6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q9D8Q6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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