Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
U2af1Q9D883 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
U2af1Q9D883 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms