Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmigd1Q9D7L8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms