Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D727 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q9D727 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q9D727 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q9D727 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q9D727 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q9D727 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D727 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Q9D727 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Q9D727 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9D727 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms