Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc52a3Q9D6X5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms