Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cmtm5Q9D6G9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cmtm5Q9D6G9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms