Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PudpQ9D5U5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms