Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sf3a3Q9D554 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms