Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms