Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4931428L18RikQ9D4S9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931428L18RikQ9D4S9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms