Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S6

Erich6b, Glutamate-rich 6B, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich6bQ9D4S6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Erich6bQ9D4S6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Erich6bQ9D4S6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms