Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Efhd1Q9D4J1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Efhd1Q9D4J1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms