Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpn3Q9D3W4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpn3Q9D3W4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms