Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700034E13RikQ9D2T6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700034E13RikQ9D2T6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms