Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nol3Q9D1X0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nol3Q9D1X0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms