Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cysrt1Q9D1E4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cysrt1Q9D1E4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms